La scheda SD di Raspberry non è troppo affidabile, specie in eventi come la caduta di tensione. Alcuni modelli di SD sono meglio di altri, ma è facile incorrere in corruzione di dati e malfunzionamenti del sistema.
La scheda SD non può essere eliminata, perché è l'unico dispositivo che Pi riconosce per alcune funzioni di inizializzazione.  Limitandone l'uso per il semplice boot, e spostando il fs  di root su altro dispositivo, si riduce le operazioni su SD  e si prevengono molti problemi.